Não, você não pode instalar o software do Windows em uma partição do Windows a partir de um sistema operacional diferente. A instalação de software geralmente envolve mais do que apenas copiar arquivos.
No entanto, softwares muito simples destinados a serem executados a partir de sua própria pasta e que não exigem adições ou alterações no Registro do Windows podem ser extraídos para a partição mencionada de outro SO em inicialização dupla ou de uma sessão ativa.
Qualquer instalador setup.exe
provavelmente será o primeiro caso.