Como fazer com que outra janela de execução de um mesmo programa seja detectada como um programa diferente?

Question

Como fazer programas de rastreamento (ManicTime, Smarter Time) detectam duas janelas de um programa como dois programas diferentes ? Os títulos exibidos podem ser alterados, mas os nomes dos processos não são.

^{FYI: Como alterar o título dos aplicativos de estilo moderno no Windows?}