O uso da unetbootin geralmente grava a partição usando o formato iso9660, o que a torna somente leitura. O que você vai querer fazer é usar a imagem FreeDOS USB e gravá-la em um USB usando algo como link e depois usando uma versão mais antiga do gparted (geralmente de um live CD do Ubuntu 14.04 deve ter idade suficiente), você pode redimensionar a partição FAT do tamanho de imagem padrão para preencher o disco (ou metade do disco se você quiser usá-lo para multi-boot com grub4dos ou algo parecido) .
Eu usei isso para criar unidades USB de atualização do BIOS e é fantástico porque posso facilmente copiar e colar atualizações mais recentes no USB sem ter que reescrever tudo (o que geralmente é necessário ao usar o unetbootin ou outras ferramentas para escrever um ISO para um USB).