apt-get instalação, diretório de caminho e programas de dependência em execução

Question

Sou muito novo no Ubuntu e, por favor, tenha paciência comigo se eu apresentar uma versão de explicação muito leiga.

Meu sistema operacional: servidor Ubuntu 11.10, versão de 64 bits

Eu preciso usar três ferramentas samtools , bowtie e tophat . No entanto, tophat depende de samtools e bowtie. O fator de dependência é - para determinar onde exatamente o caminho para as duas ferramentas acima (samtools e bowtie) estão localizados.

Agora, posso instalar samtools e bowtie usando sudo apt-get install , no entanto

• Eu não sei exatamente onde os caminhos da biblioteca existem para samtools ou bowtie
• De acordo com as notas de instalação do tophat, devo extrair a ferramenta do arquivo compactado, alterar o dir para este arquivo e ./configure; MAS eu não vejo o script ./configure no diretório extraído

Samtools e Bowtie e Tophat são encontrados em seus sites, este é o método de instalação Estou tentando seguir.

    

Answer 1

Para descobrir onde as bibliotecas estão instaladas, você pode tentar o dpkg -L samtools e o mesmo para o bowtie