A criptografia de disco total do Windows também é possível com inicialização dupla. Veja software veracrypt. Ele instala o seu bootloader para perguntar e descriptografar o disco do Windows (partição). O espaço livre restante também pode ser usado e criptografado pelo Linux, mas o grub deve ser instalado na partição linux. Para inicializar no linux você deve usar a bios f-key para escolher o rótulo uefi "linux mint". Eu fiz isso.