Aplicativo java multi-thread vs. execução de tarefas individuais usando script bash

Question

Eu tenho um aplicativo java que executa muitos threads diferentes (nem sempre dependentes um do outro) usando ScheduledThreadPoolExacutor .

Eu queria saber se isso terá algum efeito (espero) no sistema (LINUX) se eu criar arquivos jar executáveis separados para cada thread e executá-los individualmente em um loop usando um script bash.

Será que isso importa? Isso afetará o sistema, para o mal ou para o pior? Devo apenas deixá-lo como um aplicativo multi-threaded em java?

Obrigado pela sua ajuda.