Este é o documento oficial do samba: Capítulo 4. Controle de Domínio . É longo e sinuoso, mas pode ser uma boa referência.
O wiki do Ubuntu será muito útil para configurá-lo. Do link:
Samba como um controlador de domínio
Embora não possa atuar como um controlador de domínio primário (PDC) do Active Directory, um servidor Samba pode ser configurado para aparecer como um controlador de domínio no estilo do Windows NT4. Uma grande vantagem dessa configuração é a capacidade de centralizar as credenciais do usuário e da máquina. O Samba também pode usar vários back-ends para armazenar as informações do usuário.
É para 10.04 mas todos os comandos e configurações no link ainda estão funcionando para o 11.04.