Assumindo que você está usando o Ubuntu 12.10.
Instale os pacotes libpam-fprintd
e printd
do universo.
$ sudo apt-get install libpam-fprintd fprintd
Você deve ver o seguinte.
$ grep fprint /etc/pam.d/common-auth
auth [success=2 default=ignore] pam_fprintd.so
Inscreva sua impressão digital.
$ fprintd-enroll