Sim, existe uma maneira de desabilitar qualquer atalho no tmux. Você pode ver todos os atalhos que usa atualmente passando prefix+? . Para desativar o atalho, adicione unbind-key(alias: unbind) <key> ao seu tmux.conf .
echo "unbind Space" >> ~/.tmux.conf
Não se esqueça de fornecer o tmux.conf atualizado ( tmux source-file ~/.tmux.conf ) ou simplesmente reiniciar o tmux.