O comando CoordMode pode precisar ser definido para o mouse, não para a dica de ferramenta. Configure-o para qualquer modo em que suas coordenadas estejam relacionadas (tela, janela, cliente, etc. - veja a documentação)
Você também pode adicionar uma instrução #IfWinActive para limitar o escopo na atalho de chave de atalho, fazendo com que funcione somente quando uma janela do executável desejado estiver ativa, ou seja, #IfWInActive ahk_exe BPV.exe ou qualquer que seja seu programa.