Acho que descobri por que, de wiki PDF / A :
Transparent objects and layers (Optional Content Groups) are forbidden in PDF/A-1, but are allowed in PDF/A-2.
Por algum motivo estúpido da Idade da Pedra, o PDF / A-1 NÃO suporta transparência e camadas. Não há opção PDF / A-2 na palavra, então ... estou salvando agora como não compatível com PDF / A.