Tomando o ponto e a vírgula literal,
você pode testar suas RegEx aqui com explicações para cada etapa.
No NotePad ++ digite CTRL + H,
insira para pesquisa:
\[i\]([^,]+), ([^[]+)\.\[\/i\]
e para substituir:
[[$1]], [[$2]].
Selecione o botão de opção (*) Expressão Regular