Olhando o código do configure.ac
case "$host_os" in
*darwin*)
host_is_mac=yes
AC_DEFINE([ML_OS_MACOSX], [], [Mac OS X])
LFLAGS="${LFLAGS} -framework Accelerate"
CXXFLAGS="-falign-loops=16 ${CXXFLAGS}"
;;
*linux*)
AC_DEFINE([ML_OS_LINUX], [], [Linux OS])
;;
cygwin)
AC_DEFINE([ML_OS_LINUX], [], [Linux OS])
AC_DEFINE([ML_OS_CYGWIN], [], [Cygwin OS])
AC_DEFINE([ML_OS_UNIX], [], [Unix OS])
;;
*)
;;
esac
AC_MSG_ERROR([Canonical host info $host_cpu $host_vendor $host_os])
Espero ver asteriscos adicionais
*cygwin*)
como os dois casos são, geralmente:
i686-pc-cygwin
x86_64-unknown-cygwin