Certifique-se de que o proprietário do aplicativo seja root e defina as permissões de forma que apenas o proprietário possa executá-lo.
sudo chown root:root /path/to/application
sudo chmod 700 /path/to/application
Se você olhar agora para as permissões com ls -l /path/to/application
, deverá ver o seguinte: -rwx------ root root
, o que significa que o root pode ler, escrever e executar, e qualquer outra pessoa não pode ler esse arquivo.