Você pode usar um Ubuntu LiveUSB para reparar seu gerenciador de inicialização ...
Basta iniciar usando o USB ao vivo, não a outra unidade com o Ubuntu, em seguida, instalar o reparo de inicialização, aperte o botão de correção e deve ser OK após a reinicialização ..
Você pode fazer o download do reparo de inicialização usando:
sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair
sudo apt-get update
sudo apt-get install -y boot-repair && boot-repair
Dê uma olhada na página wiki para obter mais detalhes sobre o uso de reparo de inicialização