O iTunes oferecerá somente para converter qualquer arquivo que não esteja no tipo de arquivo atualmente selecionado em Prefs > Geral > Importar configurações ...
Offset de menu para legibilidade
OqueestiverdefinidoaquiseráaúnicaopçãodisponívelquandovocêacessaromenuArquivo>Converter>
... então o truque é alterar as configurações de importação para o tipo de saída desejado.
Os prefs são os mesmos para Mac & Windows, apenas a aparência é diferente.