Finalmente, encontrei a solução certa depois de muita pesquisa e tentativa e erro. O comando do sono é crucial. Aguarda o carregamento do synclient. Até agora eu coloquei para 100 segundos de tempo de espera antes de executar o comando. Talvez, um tempo de espera menor possa funcionar, mas por enquanto funciona.
sleep 100
/usr/bin/synclient RTCornerButton=0
/usr/bin/synclient RTCornerButton=0
/usr/bin/synclient RBCornerButton=0
/usr/bin/synclient TapButton3=0
/usr/bin/synclient TapAndDragGesture=0