Não há nada de errado com a formatação de uma unidade protegida pelo BitLocker. Ao fazer isso, o BitLocker é removido - em certo sentido, quando você criptografa o disco, ele está "formatando-o com bitloacker" porque o bitlocker ocupa o espaço em que os metadados do sistema de arquivos costumam ir e o move para outro lugar - e será como se você tivesse formatado qualquer outro disco.
Você, é claro, perderá todos os dados, mesmo que não faça um formato completo - e eu recomendo apenas fazer um formato rápido porque, como apontou @MichaelKjorling, um completo leva aproximadamente "idades" - porque não é mais possível descriptografar os dados antigos do disco. Eu estou supondo que você está bem com isso, no entanto.