Eu não sou um especialista em sincronização, então só posso responder por experiência própria, mas aqui está:
A: Deve ser 26131. A porta 8888 é apenas para a interface de gerenciamento.
B: não consigo confirmar para Linux ou iPhone, mas nas plataformas que estou usando (Windows, Android) você pode misturar as duas. Deixo as opções ativadas, mas também especifiquei alguns hosts predefinidos para fazer as coisas funcionarem em alguns locais onde a pesquisa não funciona devido a problemas de firewall. Não é necessário desativá-lo para que funcione.
C: Novamente, eu não sei sobre o iPhone - no Android ele está disponível, mas apenas para pastas "avançadas", não para pastas "padrão" . Então, se você está perdendo no celular, pode ser porque é uma pasta padrão, não porque você está no iPhone.