Atualmente, estou usando o El Capitan em um modelo MacBook Pro de meados de 2015 e não consigo atualizar para o Sierra. Toda vez que tento baixar o instalador da loja de aplicativos, ele conclui dizendo "baixado", mas não é encontrado em lugar algum. Eu assisto o Finder durante o download e uma parcial aparece em Aplicativos chamados 'macOS Sierra'. Quando o download for concluído, outro arquivo aparecerá em seu lugar chamado "Instalar macOS Sierra", mas esse arquivo desaparecerá imediatamente!
Não consegui encontrar mais ninguém com esse problema e parece impossível fazer o download do instalador manualmente para que eu possa executá-lo sem que a App Store decida excluí-lo.
Com o instalador em execução / aberto - Desligar a ocultação de arquivos irá resolver o seu problema.
Usando o Terminal, (apple + space ter [enter])
defaults write com.apple.finder AppleShowAllFiles SIM
killall Finder (sensível a maiúsculas e minúsculas)
Procure por 'Sierra' em Aplicativos (usuário e sistema)