Se estiver executando o Ubuntu 17.10 ou mais recente, esse problema pode surgir quando um aplicativo não foi atualizado com suporte total para o Wayland. Como uma solução alternativa até que o aplicativo seja atualizado, você pode executar
xhost +SI:localuser:root
que permitirá que o usuário root
exiba aplicativos em sua área de trabalho. Veja também este Q & A para outras soluções possíveis: Por que o gksu / gksudo ou o aplicativo gráfico com o sudo não funcionam com o Wayland?