Quando eu faço o topo, diz KiB Mem: 15396812 total e 14917020 used . Divida-os um no outro e você terá cerca de 96,8% de uso de memória.
MAS ... na lista de processos, na coluna %MEM mostra 40,5% para o mysql e depois um monte de entradas de 0.2, 0.1 e 0.0. Todos esses 0,2, 0,1 e 0,0 somados não chegam nem perto de 96,8%, então onde está toda a memória?