Acabei de ver a página de manual do synclient e precisa de um servidor X em execução.
Assim, o local usual para colocá-lo seria nos scripts do gerenciador de exibição ou no script .xsession , se o gerenciador de exibição ainda suportar (o Gnome eo KDE mudaram isso, não tenho certeza sobre o estado atual). Edite sua pergunta e indique qual gerenciador de exibição você está usando ( xdm , gdm , kdm , lightdm , ...).
Se você colocar em bashrc , ele irá executar toda vez que você iniciar um shell . Mesmo se o shell for executado em um ambiente no qual nenhum servidor X esteja ativo e nenhum touchpad estiver em uso, por exemplo, se você ssh do lado de fora. Então, enquanto isso provavelmente funcionaria, logicamente é a solução errada, e eu não recomendaria isso.