Muitos gerenciadores de pacotes do Linux removerão os arquivos de uma versão antiga ao instalar uma atualização. A atualização do driver de gráficos provavelmente fez isso - sem interrupções para qualquer coisa que você já estava executando, mas os programas recém-carregados não conseguiram encontrar os arquivos removidos, por isso os erros Failed to create GL context . A reinicialização carregou o novo driver e os arquivos associados.
Com alguns drivers (por exemplo, drivers de host VirtualBox), é possível descarregar as versões antigas após a atualização ( rmmod ) e carregar as novas versões ( insmod ou modprobe ) sem reinicializar. Isso não é possível com drivers gráficos.
Fique de olho nas atualizações futuras; talvez você queira adiar a aplicação de atualizações de kernel ou driver até que seja conveniente reinicializar.