Se você conhece a letra da unidade TrueCrypt, possivelmente algo assim:
:no
rem ping for pause (2 sec)
PING 127.0.0.1 -n 2 || PING ::1 -n 2
rem check drive is mounted
IF EXIST T:\ (GOTO yes) ELSE (GOTO no)
:yes
Veja também o link para métodos alternativos para adicionar uma pausa no arquivo em lote. Você não precisa necessariamente da seção de pausa, mas sem ela você acabará queimando mais CPU do que a necessária para verificar se a unidade está pronta. Também discutido aqui: link
Verifique a unidade discutida aqui: link