Há um grande número de possibilidades, eu duvido que eu tenha coberto todas elas, mas coisas para se olhar -
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(Não é uma resposta, mas é muito relevante) - você provavelmente não quer estar usando RAID5 neste - Software RAID 5 é lento, e RAID 5 não fornece grande confiabilidade (Veja este link ) e seu sistema é para pequeno para RAID10. Se é uma opção, pensando seriamente em substituir os discos ou modificando as coisas para que você possa usar o RAID1. (Talvez substituir o 250 gig drive com um drive de 3tb, reserve algumas partições e ter 2 conjuntos RAID1 de perto de 3TB e, em seguida, usar o LVM para torná-los um conjunto de dados perto de 6 TB). Isso será muito mais rápido, mais confiável e mais simples.
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A matriz RAID concluiu a construção? Se não, isso pode estar consumindo a maior parte do IO - a saída de cat / proc / mdadm seria útil (e mostraria se esta compilação está acontecendo)
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Seria uma boa idéia remover a cópia USB da equação, pois isso cria mais possibilidades de que o problema não esteja na matriz RAID. Tente usar ferramentas de teste de desempenho de disco - elas podem ser tão simples quanto usar "dd", "pv", mas é melhor com algo como "Bonnie ++"
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A saída do fdisk pode ser útil, pois pode mostrar problemas de alinhamento de bytes. É também, no entanto, possível que exista uma limitação de firmware que forneça um desempenho muito ruim em discos maiores que o t2b (eu corri para isso com alguns equipamentos HP mais antigos). Isso não deve ser um problema com as unidades mais novas.