Desde o Hardy (Ubuntu 8.04), você pode reinstalar o Ubuntu sem perder dados em / home, mesmo sem uma partição / home separada.
Veja
Preservando a casa ao reinstalar o Ubuntu
Desde o Hardy, o Ubuntu pode ser reinstalado preservando a casa mesmo sem separado / home: veja UbuntuReinstallation.
Poucas pessoas sabem disso, mas desde o Hardy é possível reinstalar o Ubuntu sem perder o conteúdo da pasta / home (que contém configurações do programa, favoritos da Internet, emails ... e todos os documentos, músicas, vídeos que você colocou nisso). Mesmo que / home não esteja em uma partição separada
Claro, você deve sempre ter um backup dos seus dados.