Não tenho certeza de qual versão do Windows Server você está usando, mas já tentou acessar a recomendação de linha do CMD aqui ?: Conexão de unidade mapeada perdida
Este é um resumo caso o link do site mude no futuro:
To change the default time-out period for the autodisconnect feature of the Server service, open a command prompt, type the following line, and then press ENTER
net config server /autodisconnect:number
Where number is the number of minutes that you want the server to wait before it disconnects a mapped network drive. The maximum value for this command is 65,535.
NOTE: If you set the autodisconnect value to 0 (zero), the autodisconnect feature is not turned off, and the Server service disconnects mapped network drives after only a few seconds of idle time.
Você provavelmente quer descobrir por quanto tempo ele deve permanecer ativo, já que quanto mais conexões ativas houver, maior será a carga no servidor.