Eu tenho visto problemas semelhantes, e o problema seria o fato de que a energia fornecida para as portas USB em questão é menor do que um determinado limite, após o qual a própria porta decide que não pode ser boa e se desconecta. Uma causa óbvia poderia estar sobrecarregando uma porta USB do computador principal (usando um hub USB), mas a porta USB no conector principal poderia estar tendo problemas apenas fornecendo energia para qualquer dispositivo. Então, isso significaria que o mainbord está funcionando mal, embora tudo pareça OK.