Mover um Windows existente para outra configuração de hardware não é fácil. O principal problema são os drivers (especialmente o do controlador de armazenamento).
Outro problema que pode surgir é o licenciamento de erros. Muitos computadores são fornecidos com licenças OEM, que não são intercambiáveis em diferentes hardwares. Mesmo quando você tem uma licença completa, o outro sistema provavelmente é muito diferente do original (especialmente quando você tem uma placa-mãe diferente).
A melhor coisa a fazer seria simplesmente reinstalar o Windows para que ele seja feito especificamente para sua nova configuração de hardware.