Eu tive um problema semelhante e foi uma falha no disco rígido. O passeio era uma seagate. Eles parecem ter tido uma má corrida ultimamente. Você colocou o drive externo em uma porta USB 3.0? Minha unidade não funcionaria em um 2.0, mas fez (por um tempo) no 3.0. Quando eu finalmente fiz uma reinstalação em uma unidade de 1T diferente, o processo levou muito tempo; Eu deixei durante a noite, mas foi concluído. Espero que você tenha um backup de imagem.
Boa sorte.