ignorando a segunda autenticação repetida

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Eu tenho que mover cerca de 1000 arquivos BAM com metadados e arquivos downstream (cada um no intervalo de 7-10 GB) para um servidor seguro que requer autenticação de 2 fatores. Devido a configuração no servidor, eu preciso tar cada arquivo (de outro modo, cada arquivo vai para sua própria pasta timestamped, tornando mais difícil agregar cada 'pacote BAM' novamente). Eu não tenho disco rígido extra que significa que eu tenho que usar o espaço restante na unidade existente para repetir o seguinte para cada "pequeno grupo de arquivos BAM"

  1. Tar cada arquivo BAM no pedaço "i" (e executar a soma de verificação md5 para verificar a integridade)
  2. Envie o diretório que contém o pacote via SFTP (com 2FA) para o servidor
  3. Remover o fragmento "i"
  4. Repita as etapas de 1 a 3 para o trecho "i + 1"

Eu queria saber se há uma maneira de contornar onde (idealmente) em um loop, eu forneço a autenticação de fator 2 uma vez e repita os passos 1-3 para cada arquivo BAM (tipo de deixar a sessão SFTP aguardar enquanto eu concluir a etapa 1) e enviar o trabalho para o cluster para ser concluído.

Nota: O servidor permite apenas conexão SFTP

    
por Ikram 09.12.2016 / 14:42

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