Se você se lembrar do tamanho exato da primeira partição, você pode simplesmente recriar as duas partições usando o mesmo gerenciador de partição usado anteriormente com o mesmo tamanho exato para a primeira partição. Você provavelmente perdeu o começo da primeira partição porque você a substituiu pelo kali linux iso, mas dependendo do sistema de arquivos que você tinha, você pode reparar o sistema de arquivos via fsck e recuperar a maioria ou todos os dados que não foi sobrescrito.
Supondo que o tamanho do kali iso seja menor que a primeira partição, os dados da segunda partição devem permanecer ilesos. Se você conseguir recriar a partição exatamente no mesmo local, isto é.