Parece-me que a unidade está OK, mas com um esquema de partição corrompido ou partição de inicialização / MBR.
Se isso for combinado com o seu BIOS sendo configurado para inicializar a partir dessa unidade secundária, há uma possibilidade de que ele seja interrompido se não puder encontrar uma inicialização lá.
Eu sugiro passar pelo seu BIOS para garantir que a unidade secundária seja excluída do processo de inicialização. Depois de ter instalado e funcionando, você pode solucionar a partir daí.
PS: Eu recomendo instalar gparted em um dispositivo USB para trabalhar e solucionar problemas de partições. O Windows pode ser um pouco problemático às vezes para configurações mais incomuns.