Ambos combinam com você se você disser que não se importa com os módulos. Ambos são projetados para o Windows. Então, eu não tenho nada de especial para contar.
Mas se de repente você quiser baixar módulos alguns dias no futuro, eu sugeriria o ActivePerl, já que a curva de aprendizado para usar os módulos de instalação ppm (Perl Package Manager) é muito mais fácil do que usar cpan , realmente realmente iniciante perspectiva. E note que o ActivePerl fornece as interfaces ppm e cpan , onde o Strawberry Perl tem apenas cpan
Por fim, se você realmente quiser pesquisar mais, consulte: link (ambos têm suas desvantagens, de causa)