Esta mensagem pode significar que você não habilitou a configuração do Thunderbolt corretamente na Bios (o que é estranhamente necessário, apesar de ser uma placa suplementar).
No The Bios, vá para Advanced > Thunderbolt da Intel. defina a tecnologia Intel Thunderbolt como 'Ativada'
(Se você não vir isso, talvez seja necessário atualizar seu BIOS)
Você precisará alterar o AIC Location Group e o AIC Location para configurações que dependam de onde você instalou o cartão fisicamente. Para mim, isso foi:
Grupo de Localização da AIC: CPU0 NB PCIE Slot Local da AIC: NB PCIE X16_2
agora salve essas configurações e reinicie. Se isso funcionou para você, os itens Thunderbolt na bandeja do sistema devem reagir aos dispositivos recém-instalados.
O acima foi aplicado no meu ASUS Z170-A também com um ThunderboltEX II Dual e com o objetivo de trabalhar com um dispositivo Focusrite Clarett Pre 8 X.
Estou de volta aqui para responder, porque esta pergunta me deu esperança quando eu também estava preso, boa sorte.