De: link
Nota para usuários do Windows
Please note that for historical reasons IntelHex library doesn’t use setuptools for installation task, therefore we don’t create exe-wrappers for helper scripts as hex2bin.py, bin2hex.py and other mentioned in this documentation (see section Convenience Scripts).
You can find these scripts in your python Script directory (usually C:\PythonXY\Scripts). You need either to create batch file to run them, or use Python interpreter:
python C:\PythonXY\Scripts\hex2bin.py ...
Primeiro, verifique se você alterou os diretórios para o diretório atual que possui "hex2bin.py"
ver esse erro atual me faz acreditar que você não é
python: can't open file 'hex2bin.py': [Errno 2] No such file or directory (you)
python hex2bin.py
Agora, se isso não gerar erros, tente executá-lo com args
python hex2bin.py HexFile.hex