Os sites cPanel têm uma configuração global para diretórios raiz de sites. Você não pode alterar isso sem modificar o arquivo vhosts raiz, ao qual você não deve ter acesso (se você fizer isso, por favor, informe o GoDaddy que o sistema está quebrado).
Por padrão, os servidores cPanel usam /home/<username>/public_html/
como a raiz do domínio principal de uma conta. Você pode criar addons ou subdomínios no cPanel com outra raiz, contanto que esta raiz esteja dentro do seu diretório home ( /home/<username>
).