Nada disso parece particularmente propenso a sugerir infecção. Nos anos 80, programadores habilidosos faziam coisas como tocar música para demonstrar seu domínio sobre um PC. Hoje, o malware mais comum distribuído pela Internet é motivado financeiramente, por isso os sintomas são coisas como roubar dados, inserir portas dos fundos, etc. Muitos dos vírus mais eficazes tentam não serem detectados.
Ao usar uma máquina virtual, às vezes as pessoas querem que o Alt-Tab afete a máquina virtual, não a máquina host. Portanto, não é de surpreender que você perceba uma mudança nesse comportamento.
Meu melhor palpite: você pode ter instalado algo chamado "Guest Extensions" (ou algum nome similar), que ajuda a máquina virtual a se integrar bem com a máquina host. Por exemplo, essas extensões podem incluir um driver de mouse personalizado que permite que você tenha apenas um cursor do mouse afetando as duas máquinas.
Ou pode ser uma falta de extensões de convidado. Quando você pressionou a tecla Shift, seu sistema percebeu isso. Quando você solta a tecla Shift, essa informação é transmitida ao sistema operacional convidado. Como resultado, parece que o Caps Lock está ativado.
Verifique a seção "Adicionar / Remover Programas" (o que quer que seja chamado ... No Windows 7, pode ser "Programas e Software" ou algo parecido, no Painel de Controle). Veja se há um programa separado chamado algo como "VirtualBox Host Extensions", que pode ser diferente do programa base principal.
Caso contrário, continue pesquisando. Mas eu sinto que você provavelmente pode fazer isso com bastante calma, ao invés de entrar em pânico.