A documentação do RealVNC para o mapeamento do teclado para e de um Mac (a página que você encontrou) diz que a tecla de comando esquerda (CmdL) no teclado do Mac é mapeada para a tecla Alt esquerda (AltL) em um PC. Este é o mapeamento que você encontrou.
A documentação também diz que a tecla de comando direita (CmdR) no teclado do Mac está mapeada para a tecla do Windows (WinL) à esquerda. Você já tentou o CmdR?
Observe que:
AltR and WinR can only be produced by changing the VNC parameters from their defaults.