Assumindo que "cada listagem cria seu próprio parágrafo" na pergunta, significa que há uma linha em branco antes de cada entrada e uma expressão regular substituindo (\R\R)([^\r\n].*)$ por <strong></strong> parece funcionar . Testado com o Notepad ++ v6.9.2.
Se as linhas em branco intermediárias puderem conter espaços e / ou guias, modifique a primeira captura no texto de localização para ser (\R\h*\R) .