Você pode esclarecer se está usando o software RAID do Windows (espelhamento de disco) para dois volumes de 6TB, um grande volume de 12TB ou um controlador RAID de hardware para RAID 1 ou RAID 10?
Na minha experiência (eu corrijo o RAID para ganhar a vida), mesmo que dois discos sejam da mesma marca e tipo e venham do mesmo lote do mesmo lote, eles falharão em momentos diferentes. As partes móveis são imprevisíveis e fazer com que duas falhem na mesma hora, mesmo na mesma semana, tem chances astronômicas.
Dito isto, a separação dessas unidades ainda é uma ótima ideia, já que elas são de qualidade diferente.
Um controlador de unidade decente permitirá que você selecione quais discos são colocados em quais grupos. Por exemplo, em uma placa LSI, você pode criar dois grupos de uma HSGT e uma WD normal, depois usar esses dois grupos para criar sua matriz RAID 10.
Quanto ao espelhamento de software, minha recomendação é adicionar uma unidade de cada tipo ao sistema, depois inicializar e criar o espelho deles. Os próximos dois discos que você adicionar também serão incompatíveis. Seria então impossível obter dois dos mesmos tipos de discos em um RAID juntos.