Parece que encontramos o culpado: Trusteer Rapport da IBM .
Aparentemente, o Rapport e o Chrome não se dão bem, e o Rapport pode fazer com que o Chrome se comporte de maneira estranha: link
(Pesquise o tópico acima para a palavra "Rapport").
Depois de desinstalar completamente o Rapport, não podemos mais reproduzir o problema.