Um traceroute com falha não significa que haja algo errado com o seu computador X. Você tentou um traceroute (tracert) no Computador Y (Windows)? Eu fiz, e falhou, mesmo que eu possa chegar ao www.metu.edu.tr sem qualquer problema.
Eu também não pude acessar o www.metu.edu.tr com sucesso, mesmo que ele carregue bem no navegador.
Os sites podem detectar o agente do usuário e podem decidir ignorar ou não renderizar quando você acessa o site usando um navegador específico. Você pode tentar navegar para o site usando um navegador diferente no Computador X?