parece que você está em um laptop usando a tecnologia NVidia optimums (o laptop tem o intel gpu integrado e um NVidia dedicado). Seu laptop provavelmente está superaquecendo porque agora está desconsiderando o intel inferior, e usando o overpovo NVidia gpu para tudo.
A solução no Ubuntu para isso é baixar o Bumblebee, um utilitário que atua como o driver da NVidia para dizer ao laptop quando usar o chip de maneira inteligente. Siga as instruções aqui para saber como instalá-lo.
Se você estiver executando o 14.04 ou posterior, basta ativar os repositórios Universe e Multiverse e, em seguida, executar
sudo apt-get install bumblebee bumblebee-nvidia primus linux-headers-generic
e reinicie. Para versões anteriores do Ubuntu, ou opções avançadas, veja o link acima.