Encontrei uma resposta no site. É um pequeno software que informa qual programa está marcando um arquivo como "em uso". Eu encontrei porque eu pensei que a indexação do Windows pode estar dando-lhe ajustes. Se o diretório estiver sendo indexado ativamente, posso ver isso como um problema. Mas parece que este pequeno programa no link abaixo pode lançar alguma luz sobre isso.
Como posso renomear arquivos e pastas no Windows que estão em uso?