Geralmente falando:
2.4Ghz tem maior alcance [penetrante] e se receber recepção em todo o edifício é o mais importante, então use 2.4GHz.
5Ghz tem maior velocidade. Use isso para pontos de acesso se você se sentar ao lado do dispositivo.
Disclaimer: Reflexões contra paredes, etc, podem fazer uma grande diferença por edifício. O único teste real é tentar ambos no seu destino. Eu suspeito strongmente que o 2.4GHz funcionará melhor, mas sempre há exceções.