Eu enfrentei um requisito semelhante e a solução foi usar estilos diferentes para conteúdo interno e externo. Os estilos internos são definidos como ocultos (em configurações de fonte) para que fiquem visíveis na tela, mas não ao imprimir em PDF ou papel. Apenas certifique-se de que a opção "Imprimir texto oculto" (opções do Word, em Exibir) não esteja marcada.
Você também pode definir atalhos de teclado para esses estilos internos para poder aplicá-los rapidamente durante o documento. E para ocultar ocasionalmente algum texto, você pode criar um estilo de caractere (em oposição a um estilo de parágrafo) definido como oculto, fornecer um atalho de teclado e marcar qualquer texto e ocultá-lo rapidamente.