O que vemos na saída do diskpart:
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O disco 0 é do estilo GPT (o disco 1 parece ser USB? no estilo MBR)
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O System BCD está sempre na partição do sistema EFI (partição 1 no disco 0 no seu caso)
Você pode mapear a partição 1 depois de selecioná-la usando assign
.
Saia do diskpart.
Em seguida, no prompt de comando, você pode executar chkdsk
.
Existe também uma solução muito fácil para mapear o Sistema EFI: