Eu deveria ter mencionado que estou usando a placa-mãe original do Big Bang XPower. Aparentemente, há um problema em que o recurso VT-d causa um conflito com o controlador SATA 3 e os discos nas portas SATA 3 não podem mais ser detectados. Eu descobri isso depois de desconectar as unidades e movê-las para portas diferentes. Desativar o VT-d reativa as portas.